Opis usługi
Metylacja DNA w piątej pozycji cytozyny (5-mC) jest stałą epigenetyczną modyfikacją i odgrywa ważną rolę w wielu biologicznych procesach, w tym w wyciszaniu genu, tłumieniu elementów transpozycyjnych, impritingu genomowym, dezaktywacji chromosomu X. Detekcja i analiza ilościowa metylacji są bardzo ważne dla zrozumienia ekspresji genów i innych procesów będących przedmiotem regulacji epigenetycznej.
Sekwencjonowanie całego genomu po reakcji z wodorosiarczynem (WGBS) jest używana do detekcji metylowanych cytozyn po traktowaniu DNA wodorosiarczynem sodu przed sekwencjonowaniem. WGBS stał się złotym standardem do badania metylacji całego genomu na poziomie jednej zasady.
Wybór sekwenatorów do WGBS
Usługi sekwencjonowania całego genomu po reakcji z wodorosiarczynem BGI przeprowadzane są za pomocą technologii sekwencjonowania DNBseq™ (BGISEQ), lub wyjątkowo na sekwenatorach Illuminy w celu uzyskania znakomitych wyników w rozsądnej cenie w branży.
DNBseq™ jest własną technologią sekwencjonowania firmy BGI, opracowana filię firmy BGI Complete Genomics w Dolinie Krzemowej.
Etapy projektu
Przygotowanie próbki i usługi
Firma BGI dba o próbki klienta od rozpoczęcia projektu do raportu z wynikami. Doświadczeni specjaliści laboratoryjni przestrzegają ścisłych procedur jakościowych, aby zapewnić rzetelność wyników.
Specyfikacja usług sekwencjonowania
Standardowa jakość sekwencjonowania
Czas realizacji
Wymagania dotyczące próbki
Firma BGI akceptuje próbki gDNA, krwi pełnej, linii komórkowej, świeżej zamrożonej tkanki i FFP i aplikacje jednokomórkowe spełniające poniższe ogólne wymagania:
Czystość: OD260/280³ 1.8 ~ 2.0 bez degradacji czy kontaminacji RNA
Analiza danych
Analiza standardowa
Analiza na zamówienie
BGI oferuje szerokie możliwości analizy zapewniające niezrównaną elastyczność w dostarczaniu wiarygodnych danych w celu osiągania różnych celów badawczych, od badań nad rakiem po zrozumienie podstawowych procesów komórkowych.